Microbiote versus microbiome

Récemment, dans le cadre du projet Microbiome Support, un groupe réunissant plus de 30 experts dans le domaine a redéfini les deux termes en leur donnant une définition simple.

Le microbiote correspond à l’assemblage des micro-organismes présents dans un environnement défini. Plus spécifiquement, le microbiote varie en fonction de son environnement. Le terme microbiote est suivi du nom de l’environnement dans lequel il se trouve. Par exemple, le « microbiote intestinal » fait référence au microbiote présent dans les voies intestinales.

Le microbiome fait référence à l’ensemble des gènes hébergés par des micro-organismes, ce que l’on appelle le théâtre d’activité. En d’autres termes, le mot « microbiome » désigne l’ensemble des génomes et des gènes des membres d’un microbiote dans un habitat spécifique.

Le microbiote humain correspond à l’ensemble des micro-organismes, parmi lesquels figurent les bactéries, les archébactéries, les champignons et les virus. Sa diversité varie en fonction de tout un éventail de facteurs. Le microbiome a de nombreuses fonctions essentielles dans les habitats où il vit, et ce n’est que maintenant que les découvrent ce qu’il fait et pourquoi il est important.